树木根系深入土层的深浅和范围与树木的生长、开花、结实等有着密切的关系，而影响根系分布深度的主要条件是土层的有效厚度和理化性质。栽植前的挖穴虽然达到了相当的深度，但随着树木的生长，穴壁以外紧实土壤的不良性状就会妨碍根系的生长和营养的吸收。
深挖土壤并结合施用适量的有机肥是改良土壤肥力的最好方法。但是，如果把有机质盲目地施在潮湿或极酸的贫瘠土壤中，深挖施肥并不能获得令人满意的效果。在这种情况下，必须通过地下排水或通过挖掘爆破等方式，打破地下不透水层，排除过多的渍水，或通过底土施用石灰克服极酸的障碍，促进微生物的活动和有机质的分解，加速土壤熟化，使难溶性物质转化成有效的养分。
深挖的深度与地区、土壤、树种及深挖的方式有关。黏重土壤应挖得较深，沙质土壤可适当浅挖；地下水位高时宜浅挖，下层为半风化的岩石时则宜加深，以增厚土层；深层为砾石，也应深挖，拣出砾石并换好土，以免肥、水淋失；地下水位低、土层厚、栽植深根性树木时则宜深挖，反之宜浅；下层有黄淤土、白干土、胶泥板或建筑地基等残存物时，挖的深度以打破此层为宜，以利渗水。
可见，深挖的深度要因地区、因树种而异，在一定范围内挖得越深效果越好，一般为60至100厘米，最好距离根系主要分布层稍远一些，以利根系向纵深生长，扩大吸收范围，提高根系的抗逆性。此外，环状深挖与辐射深挖可深一些，全面深挖应浅些，而且要掌握离干基越近越浅的原则。
土壤深挖应结合施肥（主要是有机肥）和灌溉进行。挖出的土壤经打碎，清除砖石杂物后最好与肥料拌匀以后回填。如果土壤不同层次的肥力状况相差悬殊，则应将表土层的土壤回填在根系密集层范围内，心土放在表层。这样不但有利于根系对养分的吸收，促进根系的快速恢复和生长，而且有助于心土的熟化。